实验室在教育部和四川省教育厅的指导下，严格按照教育部重点实验室建设与管理办法运行和管理。以“发挥优势、突出重点”为指导思想。实行“开放、流动、联合、竞争”的运行机制。

学校成立校领导负责的，科技、人事、财务、国有资产、研究生部等部门参加的重点实验室管理委员会，协调处理实验室建设、运行与管理中的重大问题。

实验室实行学校领导下的主任负责制，由主任负责实验室的全面工作。实验室设立4名副主任，负责实验室的日常管理。同时，实验室设立办公室主任1名，协助做好实验室的日常管理工作。管理人员如下：